公式Wikiにて、
If using the Kodi UPnP Server, these browse tree nodes are based on the Kodi library nodes and you can create additional nodes in the Kodi server to expand the browse tree.
Kodi UPnP サーバーを使用している場合、これらのブラウズ ツリー ノードは Kodi ライブラリ ノードに基づいており、Kodi サーバーに追加のノードを作成してブラウズ ツリーを拡張できます。
となっているので、デフォルトのxmlファイルの必要最低限をuserdata/library/musicにコピーしたが、kodiのローカル画面では反映され使わないノードが表示されなくなった。
しかし、サーバー機能を使用しているiPhoneのfidataアプリ側からはデフォルトノードがそのまま表示されて全く変わらない。
テストでWindows環境でデフォルトノードを強制削除（xml拡張子をリネーム）したが変わらず。
Wikiでデフォルトノードは変更せず、変更したい場合はuserdata/libraryにmusicを作成しコピーするとあった。
なので、カスタムノードが反映されないのでデフォルトノードを強制変更してみたが失敗。
Kodiの内部（バイナリ）で保持されているとは思えないので、どこかにdlan・UPnPサーバに対する記述が有るはず。*1
*1:+_+
